北京胤达歆科技有限公司
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MLPA技术交流
 
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一.MLPA遗传性乳腺癌相关试剂盒:

货号

规格

产品描述

P002

25R/50R/100R

检测 BRCA1 每个外显子,可用于初筛。

P087

25R/50R/100R

用于确诊 P002 的结果。

P239

25R/50R/100R

检测 BRCA1 上游及下游序列,用于 BRCA1 缺失重复的深入检测

P045

25R/50R/100R

BRCA2 所有外显子及 CHEK2

P090

25R/50R/100R

针对 BRCA2 的探针与 P045 一样,但不包括 CHEK2 探针

P077

25R/50R/100R

可用于验证 P045/P090 的结果

P190

25R/50R/100R

BRC 易感基因检测,包括 CH3K2,ATM,BRCA1,PTEN,TP53

P078

25R/50R/100R

检测一些在侵入性乳腺癌治疗的过程,发展及反应中起到明显作用的基因

P376

25R/50R/100R

类 BRCA1 乳腺癌谱检测

文献:

Hogervorst F.B. et al. (2003). Large genomic deletions and duplications in the BRCA1 gene identified by a novel quantitative method.

二. MLPA 筛查智力障碍儿童的染色体变化流程:


在一部分情况下,病人的特殊病征可以让我们知道是哪些基因引起的疾病。MLPA 有许多试剂 盒可以用于寻找有明显综合征病征病人的病因,比如雷特氏综合征,普瑞德威利症候群,安琪儿 综合征等。 而对于没有明显综合征病征的智障患者,其基因病理大部分情况下很难被找到。一般情况下,这些 病人首先要通过基因分型或 G 显带核型分析检测;如果未发现异常,可使用 P245/P297 微缺失综 合征试剂盒及 P036/P070 广泛亚端粒筛查试剂盒对病人进行筛查。

P245:微缺失综合征试剂盒

可筛查 23 种可引起智力障碍的微缺失综合征。如果使用 P245 筛查时发现问题,可进一步用 微缺失追踪试剂盒对病人基因缺陷进行更精确的诊断。
可筛查以下微缺失综合征

1p36 deletion syndrome

15q24 deletion syndrome

DiGeorge region 2, 10p15

Rubinstein-Taybi syndrome

2p16 microdeletion

17q21 microdeletion

Langer-Giedion syndrome, 8q

Smith-Magenis syndrome

2q23 microdeletion / MBD5

22q13 / Phelan-McDermid

Miller-Dieker syndrome, 17p

Sotos syndrome 5q35.3

2q33 microdeletion / SATB2

Cri du Chat syndrome, 5p15

NF1 microdeletion syndrome

Williams syndrome

3q29 microdeletion

DiGeorge syndrome 22q11

Prader-Willi / Angelman

Wolf-Hirschhorn 4p16.3

9q22.3 microdeletion

Distal 22q11 region

MECP2 / Xq28 duplication

 
P297:可筛查一些新发现的微缺失综合征

1q21.1 (TAR syndrome)

7q36.1(CNTNAP2 gene)

15q24.1(PML gene)

18q21.2(TCF4 gene)

1q21.1 (other than TAR)

12p11.23 (implicated in schizophrenia)

16p11

20p12.2(PAK7 gene)

3q29

15q13

17q12

P064 筛查多种微缺失/微重复引起的智力障碍

1p36 deletion syndrome

7p21 Saethre/Chotzen syndrome

15q11 Prader-Willi / Angelman syndrome

4p16 Wolf-Hirschhorn syndrome

7q11 Williams-Beuren syndrome

16p13 Rubinstein-Taybi syndrome

5p15 Cri du Chat syndrome

8q24 Langer-Giedion syndrome

17p13 Miller-Dieker syndrome

5q35 Sotos syndrome

11p13 WAGR syndrome

17p11 Smith-Magenis syndrome

20p12 Alagille syndrome

22q11 DiGeorge syndrome

22q13 Phelan-McDermid syndrome

P371-P374 微缺失追踪试剂盒:
P245 微缺失综合征筛查试剂盒可筛查 21 种引起智力障碍的微缺失综合征。而 P371-P374 在 这 21 个区域内有更多的检测探针,可用于病人基因缺陷原因的进一步确认。4 个试剂盒针对的疾 病类型如下:

P371 Microdeletion syndromes5

2p16,LangerGiedion,9q22,WAGR,15q24,17q21

P372Microdeletion syndromes6

Sotos,DiGeorge,Rubinstein-Taybi,NF1

P373Microdeletion syndromes7

1p36,3q29,Wolf-Hirschlorn,CriduChat,Phelan-McDermid

P374Microdeletion syndromes8

7q11,PWS/AS,Miller-Dieker,Smith-Magenis,RETT

 
 P036/P070/P069 广泛亚端粒筛查试剂盒

在所有的智力障碍病例中,有 3%-8%是由于亚端粒的拷贝数异常引起的。这三个试剂盒都包 括了每个亚端粒的探针,可以检测出每个亚端粒的缺失/重复。建议同时使用 2 个试剂盒以提高筛 查到的概率。
     
P036 和 P070 大部分探针的目标序列为临近端粒的已知基因。但是 13,14,15,21 和 22 染色体 的 p 臂覆盖有 10Mb 的重复序列,因此在这些地方的“p 探针”识别序列其实是临近 p 臂的 q 臂 上的第一个基因。P069 则不包含这些“p 探针”。
     
P069 与 P070 高度相似,除了在 1q,17p,20p 和 Xp 区域的检测序列不同之外,二者其它 的探针均相同。

P036 试剂可以作为独立的试剂盒验证后两者的结果。除了 X/Y 染色体长臂探针中 的 VAMP7(SYBL)三者一致外,P069 和 P070 的探针都与 P036 试剂盒不同。
     
在 X、Y 染色体短臂的端粒末端有一处大约有 2500Kb 的区域,在两个性染色体中完全一致,称作假染色体区域 1 或者 PAR1。类似的,另有 PAR2,指的是在两个性染色体长臂的端粒末端 6 相同的 800Kb 区域。PAR 区域的基因在大多数男性或者女性中都有一致的拷贝数,如同普通常染 色体上的遗传基因一样。这三个试剂盒针对 X/Y 染色体的两个 PAR 区域都有一个探针,同时也有 针对 Y 染色体上非端粒的特异序列的两个较小的人工合成 MLPA 探针。
     
追踪套装试剂盒亚端粒区域拷贝数的检测比较复杂,亚端粒拷贝数改变在正常人群中也有可能存在,取决于拷贝数发生改变的基因。单一一个探针检测出来的拷贝数异常有一部分并不会表现出明显表型,这有 可能是由于基因的多态性或由于父母亲遗传下来的。在一些染色体臂中,大片段(>1Mb)的亚端 粒缺失可以被遗传到子代而没有表型影响。基于这些考虑,可用端粒筛查试剂盒对拷贝数变异进行 更精确的检测。

端粒追踪套装试剂盒是 12 个端粒筛查试剂盒的整合,用于进一步筛查由广泛亚端粒筛查试剂盒筛查出来的端粒异常。12 个试剂盒覆盖了每个亚端粒,包含了 46 个区域的 465 个探针。其覆盖范围如下:

P208HumanTelomere-6

2p,3p,6p,8p

P291HumanTelomere-12

13q,14q,15q,16q

P230HumanTelomere-7

9p,10p,11p,12p

P320HumanTelomere-13

17q,18q,19q,20q.

P249HumanTelomere-8

17p,18p,19p,20p

P365HumanTelomere-14

7p,15q-cen,16p, 21qcen, 21q

P264HumanTelomere-9

1q,2q,3q,4q

P356Chromosome22q

22q11,22q13

P277HumanTelomere-10

5q,6q,7q,8q

P358HumanTelomere

 

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